Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Phf11bB4XVQ1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Phf11bB4XVQ1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Phf11bB4XVQ1 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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