Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cfap58B2RW38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap58B2RW38 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap58B2RW38 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap58B2RW38 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms