Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rrn3B2RS91 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rrn3B2RS91 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rrn3B2RS91 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
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