Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Otud4B2RRE7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Otud4B2RRE7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Otud4B2RRE7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otud4B2RRE7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms