Protein–RNA interactions for Protein: B2RQY6

BC035947, BC035947 protein, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035947B2RQY6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BC035947B2RQY6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
BC035947B2RQY6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BC035947B2RQY6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms