Protein–RNA interactions for Protein: B2RQC2

Usp42, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 42, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp42B2RQC2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Usp42B2RQC2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Usp42B2RQC2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Usp42B2RQC2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms