Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Scn7aB1AYL1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Scn7aB1AYL1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
Scn7aB1AYL1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Scn7aB1AYL1 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Scn7aB1AYL1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms