Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Nipsnap3aB1AWZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms