Protein–RNA interactions for Protein: B1AVH7

Tbc1d2, TBC1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d2B1AVH7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tbc1d2B1AVH7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tbc1d2B1AVH7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tbc1d2B1AVH7 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms