Protein–RNA interactions for Protein: B1AV60

Nhs, NHS actin-remodeling regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NhsB1AV60 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NhsB1AV60 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
NhsB1AV60 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
NhsB1AV60 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NhsB1AV60 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC33.15■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NhsB1AV60 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
NhsB1AV60 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NhsB1AV60 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NhsB1AV60 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms