Protein–RNA interactions for Protein: A9Z1V5

Vwa5b1, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B1, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwa5b1A9Z1V5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Vwa5b1A9Z1V5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vwa5b1A9Z1V5 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Vwa5b1A9Z1V5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Vwa5b1A9Z1V5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms