Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
H2-M5A7VMS3 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
H2-M5A7VMS3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
H2-M5A7VMS3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
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