Protein–RNA interactions for Protein: A6H6S0

Herc3, Hect domain and RLD 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc3A6H6S0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Herc3A6H6S0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Herc3A6H6S0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Herc3A6H6S0 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.3 ms