Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E8

Ttll6, Tubulin polyglutamylase TTLL6, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll6A4Q9E8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll6A4Q9E8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ttll6A4Q9E8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ttll6A4Q9E8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Ttll6A4Q9E8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ttll6A4Q9E8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms