Protein–RNA interactions for Protein: A2AM80

Fam43b, Family with sequence similarity 43, member B, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam43bA2AM80 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam43bA2AM80 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam43bA2AM80 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam43bA2AM80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam43bA2AM80 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam43bA2AM80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fam43bA2AM80 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam43bA2AM80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam43bA2AM80 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms