Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB1

Ccdc183, Coiled-coil domain-containing protein 183, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc183A2AJB1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ccdc183A2AJB1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc183A2AJB1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc183A2AJB1 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc183A2AJB1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms