Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ccdc163A2AGD7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ccdc163A2AGD7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ccdc163A2AGD7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms