Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cdc27A2A6Q5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdc27A2A6Q5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdc27A2A6Q5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc27A2A6Q5 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc27A2A6Q5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdc27A2A6Q5 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms