Protein–RNA interactions for Protein: A0A286YCZ6

1700016G14Rik, RIKEN cDNA 1700016G14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
1700016G14RikA0A286YCZ6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
1700016G14RikA0A286YCZ6 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms