Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms