Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YVH6

1520401A03Rik, RIKEN cDNA 1520401A03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
1520401A03RikA0A0J9YVH6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.6 ms