Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P8

Trbv13-1, T cell receptor beta, variable 13-1 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Trbv13-1A0A0B4J1P8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.9 ms