Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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