Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Krt27Q9Z320 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Krt27Q9Z320 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Krt27Q9Z320 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms