Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp5Q9Z2P8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Vamp5Q9Z2P8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.4 ms