Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W3

Nup160, Nuclear pore complex protein Nup160, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup160Q9Z0W3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
Nup160Q9Z0W3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.36■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
Nup160Q9Z0W3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Nup160Q9Z0W3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Nup160Q9Z0W3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC35.17■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Nup160Q9Z0W3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms