Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVG6

Carm1, Histone-arginine methyltransferase CARM1, mousemouse

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carm1Q9WVG6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Carm1Q9WVG6 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Carm1Q9WVG6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Carm1Q9WVG6 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Carm1Q9WVG6 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Carm1Q9WVG6 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Carm1Q9WVG6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Carm1Q9WVG6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Carm1Q9WVG6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Carm1Q9WVG6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms