Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUL8

Cited4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited4Q9WUL8 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cited4Q9WUL8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cited4Q9WUL8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cited4Q9WUL8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms