Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tnfsf13bQ9WU72 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tnfsf13bQ9WU72 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tnfsf13bQ9WU72 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 236.6 ms