Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU56

Pus1, tRNA pseudouridine synthase A, mousemouse

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus1Q9WU56 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pus1Q9WU56 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pus1Q9WU56 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pus1Q9WU56 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms