Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Lemd3Q9WU40 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Lemd3Q9WU40 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
Lemd3Q9WU40 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Lemd3Q9WU40 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
Lemd3Q9WU40 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms