Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Syt6Q9R0N8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Syt6Q9R0N8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Syt6Q9R0N8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms