Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Bcl11aQ9QYE3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Bcl11aQ9QYE3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Bcl11aQ9QYE3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Bcl11aQ9QYE3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms