Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXS8

Cml5, Probable N-acetyltransferase CML5, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cml5Q9QXS8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cml5Q9QXS8 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cml5Q9QXS8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cml5Q9QXS8 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms