Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXF8

Gnmt, Glycine N-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GnmtQ9QXF8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
GnmtQ9QXF8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
GnmtQ9QXF8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
GnmtQ9QXF8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GnmtQ9QXF8 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GnmtQ9QXF8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GnmtQ9QXF8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GnmtQ9QXF8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GnmtQ9QXF8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GnmtQ9QXF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GnmtQ9QXF8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms