Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trpc5Q9QX29 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Trpc5Q9QX29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trpc5Q9QX29 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trpc5Q9QX29 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trpc5Q9QX29 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms