Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWL7

Krt17, Keratin, type I cytoskeletal 17, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt17Q9QWL7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt17Q9QWL7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt17Q9QWL7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Krt17Q9QWL7 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Krt17Q9QWL7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Krt17Q9QWL7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Krt17Q9QWL7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms