Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc2lQ9JME7 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trappc2lQ9JME7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trappc2lQ9JME7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms