Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Sfmbt1Q9JMD1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sfmbt1Q9JMD1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms