Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLR9

Higd1a, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1aQ9JLR9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Higd1aQ9JLR9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Higd1aQ9JLR9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Higd1aQ9JLR9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms