Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CtsmQ9JL96 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtsmQ9JL96 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CtsmQ9JL96 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms