Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV7

Extl1, Exostosin-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Extl1Q9JKV7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Extl1Q9JKV7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Extl1Q9JKV7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Extl1Q9JKV7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Extl1Q9JKV7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms