Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF4

Clec6a, C-type lectin domain family 6 member A, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec6aQ9JKF4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Clec6aQ9JKF4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Clec6aQ9JKF4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clec6aQ9JKF4 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Clec6aQ9JKF4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms