Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKA5

Gpa33, Cell surface A33 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpa33Q9JKA5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gpa33Q9JKA5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Gpa33Q9JKA5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpa33Q9JKA5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.3 ms