Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ9

Cngb3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb3Q9JJZ9 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cngb3Q9JJZ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cngb3Q9JJZ9 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cngb3Q9JJZ9 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177 ms