Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ8

Cnga3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga3Q9JJZ8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cnga3Q9JJZ8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cnga3Q9JJZ8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cnga3Q9JJZ8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cnga3Q9JJZ8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
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