Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cacna1fQ9JIS7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cacna1fQ9JIS7 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cacna1fQ9JIS7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Cacna1fQ9JIS7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms