Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
RabggtaQ9JHK4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RabggtaQ9JHK4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RabggtaQ9JHK4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RabggtaQ9JHK4 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
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