Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES64

Ush1c, Harmonin, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ush1cQ9ES64 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ush1cQ9ES64 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ush1cQ9ES64 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ush1cQ9ES64 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ush1cQ9ES64 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms