Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQM5

Rhox9, Homeobox protein GPBOX, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox9Q9EQM5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Rhox9Q9EQM5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rhox9Q9EQM5 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Rhox9Q9EQM5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms